Muñoz, investigó causas emblemáticas de Derechos Humanos, como la muerte del ex presidente de la ANEF, Tucapel Jiménez, y el caso Riggs, sumando numerosas peticiones de desafuero en contra de Augusto Pinochet. Llegó a la Suprema en 2005, y encabezó en los últimos años la Tercera Sala del tribunal máximo del país, que paralizó multimillonarios proyectos energéticos y mineros por vulnerar normas ambientales.