Para evitar la introducción desde el extranjero de enfermedades o plagas que puedan afectar a los animales o vegetales y dañar gravemente a la agricultura, se han establecido los Controles Fronterizos fito y zoo sanitarios. Dichos Controles funcionan en los lugares de entrada al país, ya sea por vía terrestre, aérea o marítima. Allí se inspeccionan los productos, medios de transporte, equipaje de pasajeros, tripulación y cargas comerciales de productos silvoagropecuarios (frutos, leche, queso, etc.) para verificar que cumplen con las regulaciones sanitarias establecidas.
Al exportar productos animales o vegetales, el SAG participa en su certificación sanitaria, la que es reconocida internacionalmente por haber sido elaborada en base a normas y estándares que regulan el comercio mundial. Para lograr dicho reconocimiento se suscriben acuerdos con otros países.
La labor del Servicio Agrícola y Ganadero (SAG), En el Paso Fronterizo Rio Don Guillermo, es detectar el ingreso al país de productos orgánicos, que contempla; frutas, verduras, carne, salame, huevos, miel, etc., pero no el ingreso de drogas. Aquí se fiscaliza todo tipo de vehículos que ingresan al territorio nacional, pero los más fiscalizados son buses transfer, donde viajan turistas con destino a Torres del Paine, Puerto Natales y Punta Arenas, por ser una entrada turística.
Dentro de la inspección de productos orgánicos, principalmente se encuentran, en su mayoría, frutas y verduras que los turistas portan para consumir en el camino o para cocinar cuando lleguen a su lugar de destino. Al momento de ser detectadas, se les explica que no pueden ingresar el producto y que tienen que entregarla de forma voluntaria.
Destacar que gracias a la labor canina se facilita bastante el trabajo, siendo mucho más rápido, sobre todo en buses, en la cual los pasajeros no tienen la obligación de bajar los bolsos. La labor del perro es encontrar estos productos de una manera no intrusiva, no revisar los bolsos manualmente, sino que el perro entrega la alerta donde viene algún producto de riesgo.