La secuenciación masiva fue hecha desde muestras de pingüinos, mamíferos marinos y bacterias obtenidas en la isla Rey Jorge.
Este proyecto busca identificar y obtener bacterias ácido-lácticas con potencial biotecnológico. La idea es aislar estas bacterias desde diferentes fuentes como son pingüinos, mamíferos y muestras ambientales que se encuentran en la Antártica y luego probar si pueden ser usadas como productos probióticos o remediadores ambientales, objetivos que son parte de la tesis de posgrado de Olga Herrera, estudiante de Doctorado en Recursos Hídricos y Energía para la Agricultura de la Universidad de Concepción.
En la actualidad, gran parte de las investigaciones microbiológicas y ecológicas incluyen secuenciación masiva entre sus actividades. A la fecha, esta se realiza en Chile continental y muchas veces se envía al extranjero para su procesamiento. Usualmente, el transporte de las muestras requiere de cuidado y cadena de frío. El proceso completo es lento y tedioso y uno puede tener resultados meses después de haber tomado la muestra.
Con esta tecnología es posible soslayar esas complicaciones y tener resultados en tiempo real, evitando todos los problemas asociados al flujo de trabajo propio de estas técnicas. “Para ejemplificar, nosotros en la mañana estábamos tomando las muestras y por la tarde secuenciando, algo inimaginable hasta hace algunos años atrás. El implementar la tecnología en Escudero abre las puertas a otros investigadores quienes siempre están interesados en la secuenciación; ellos también podrían hacerlo sin ningún problema acá mismo en Antártica”, comenta el Dr. Neira.
Por su parte, el Dr. Javier Ferrer agrega que “el tener la oportunidad de colaborar con un equipo multidisciplinar en la Antártica y además poder analizar en tiempo real la microbiología tanto de las muestras originales como de los consorcios con potencial biotecnológico ha sido una experiencia muy enriquecedora”.
Gracias a la colaboración con el Dr. Sunil Mor (Universidad de Minnesota) y el Dr. Víctor Neira (Universidad de Chile) fue posible implementar un equipo de secuenciación masiva y lograr así este gran hito, las primeras secuenciaciones masivas en la base Escudero.